蛋白质的分离纯化在生物化学研究应用中使用广泛，是一项重要的操作技术。蛋白纯化要利用不同蛋白间内在的相似性与差异，利用各种蛋白间的相似性来除去非蛋白物质的污染，而利用各蛋白质的差异将目的蛋白从其他蛋白中纯化出来。每种蛋白间的大小、形状、电荷、疏水性、溶解度和生物学活性都会有差异，利用这些差异可将蛋白从混合物如大肠杆菌裂解物中提取出来得到重组蛋白。分离纯化蛋白是生命科学研究且必要的技术手段，也是生物制品药物生产的最重要步骤。
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