在现代生物学、医学及转化医学、药物学等研究中,随着功能基因组研究的深入,生物大小分子的生物学功能研究占据着非常重要的地位 ,分子相互作用分析仪已成为生命科学领域研究不可缺少的一项重要工具,其中最经典当属GE的Biacore的SPR技术,近年来市场上开发出了很多新的品牌,至于孰强孰弱很难辩解, 唯有事实胜于雄辩,接下来给大家展示一下市面上比较主流的OpenSPR、Biacore和ForteBio 对同一组蛋白与抗体的检测结果:
实验内容
1. 利用OpenSPR 、Biacore 和Octet 对生物素化CD16a和IgG的结合动力学的特性进行了对比;
2. OpenSPR 、Biacore 和Octet 测量的KD值分别为74.7 nM、48.7 nM和226 nM;
3. 本研究证实OpenSPR与其他用于分析结合动力学和亲和力的商业仪器具有等效性;
OpenSPR 是一个功能强大的仪器,可对各种不同的分子相互作用提供深入的无标记的结合动力学检测和分析。为证明OpenSPR 的强大功能和准确性,我们和Biacore 3000及Octet RED96检测数据进行比较分析。Biacore 和Octet 系统通常用于分析结合动力学,但成本高达数十万美元,因此许多需要这些数据的研究人员无法使用它们。为了证明OpenSPR 能够以较低的成本获得与Biacore 和Octet 相当的结果,我们用这三款仪器在相似的条件下分析了Fc-FcR相互作用。
与行业标准Biacore 或Octet 相比,OpenSPR 的成本是多少?
OpenSPR是一种台式SPR解决方案,它给研究人员提供了在自己的实验室中完成深入的无标记结合动力学检测。与制药行业的标准SPR或BLI解决方案相比,Biacore SPR和Octet BLI仪器的成本高达数十万美元,而OpenSPR则需要他们差不多一半的价格,因此只需一小部分成本便可获得与Biacore 和Octet 相同的数据,并且仪器出结果速度快,操作简单, 研究人员能够以比Biacore 和Octet 系统更快速度进行研究和发布研究成果。
比较研究:OpenSPR 、Biacore 和Octet 对Fc-FcR的相互作用分析
研究中,我们用OpenSPR 、Biacore 3000和Octet RED96检测了Fc-FcR相互作用结合动力学。Biacore 和Octet 实验由CRO训练有素的技术人员操作,OpenSPR实验由Nicoya科学家进行。本研究的目的是验证OpenSPR与其他用于分析结合动力学和亲和力的商业仪器的等效性。采用动力学分析方法分析了Fc-FcR相互作用的kon、koff和KD,具体结果如下(注:如果您想了解更多关于本比较中使用的材料、协议和设备,您可以查看我们的详细技术说明):
结果
用OpenSPR 、Biacore 和Octet 仪器检测的Fc-FcR相互作用结果分别见图1、图2、图3和表1。各实验数据采用1:1结合模型拟合 。OpenSPR 、Biacore 和Octet 测定的KD值分别为74.7 nM、48.7 nM和226 nM。OpenSPR和Biacore 3000之间的计算KD值非常接近,而Octet 报告的值相差约5倍。由拟合得到的动力学常数如表1所示。三款仪器的解离速率都相似,但是Octet 的on-rates的差异超过了一个数量级。OpenSPR 和Biacore 拟合质量相当,但Octet 数据偏差较大。
受仪器本身的特点及操作的限制,即使在同一台仪器上进行重复实验,也经?;峥吹讲饬康降那缀土投ρе档谋浠iacore 和OpenSPR 实验值的接近证明了这些用于生物分子相互作用分析仪器的可比性。观察到的微小差异可能是由于在精确的实验条件和使用的材料上的微小差异造成的。Octet数据的较大差异可能是由于使用了较高的固定水平、拟合差异或BLI使用的dip和read技术的基本差异。
结论
综上所述,OpenSPR 和Biacore 仪器对同一组实验获得相似的动力学和亲和力值,有力的支持了可使用OpenSPR 准确且经济进行分子间结合相互作用的检测和研究。