灭菌设备主要有高温加热灭菌（120℃灭菌），蒸汽灭菌，蒸煮灭菌锅，微波灭菌设备，辐射灭菌等。根据消毒机械类别有：水浴消毒锅，喷淋消毒锅，紫外线消毒，臭氧消毒器，巴氏消毒，瞬间消毒机这个大类。

压力蒸汽灭菌器可杀灭所有微生物，包括孢子，是比较好的灭菌效果，是最广泛使用的灭菌方法。该方法是将待灭菌的物品放入高压釜中，加热时蒸汽不会溢出，高压釜中的温度随着蒸气压的升高而升高。在103.4kPa（1.05kg / cm 2）的压力下温度达到121.3℃，并保持15至20分钟。对于一般培养基，盐水，手术器械，玻璃容器和注射器，敷料等物品灭菌。

在使用医用灭菌器进行工作时，首先会用45-48℃的无菌水把专用药粉溶解，再用循环泵把溶液泵入器械腔内部和清洗盘内循环，使药液与清洗干净的器械腔内外表面充分接触至指定时间，达到器械完全灭菌状态。

高效能医用灭菌器灭菌。主要用于内镜特殊手术器械的快速灭菌，该仪器为低温灭菌器，通过45-48℃的无菌水将药粉溶解，再用循环泵把溶液泵入器械内部和清洗盘内循环，使药液与清洗干净的器械内外表面充分接触至指定时间，达到器械完全灭菌。

然后两次将无菌水泵入器械内部和清洗盘内循环清洗，以清除器械内外表面的残留药液.最后用真空泵把器械内的水抽干，最高灭菌温度为60℃，20分钟可完成器械的灭菌。低温灭菌对内镜器械及光学镜面损伤较小，且灭菌时间短，适合于手术器械少又开展连台手术的医院。